O Centro de Estudos Migratórios está em atividade na Missão Paz desde 1968, carregando uma tradição de diálogo constante com a comunidade acadêmica e migrante.

O CEM conta com uma biblioteca especializada na temática de Migração e Refúgio, além de um Centro de Memória e Documentação da Missão Paz. As visitas monitoradas são conduzidas pelo Centro de Estudos Migratórios, através da biblioteca.

Desde 1988, o CEM é responsável pela edição da Revista Travessia e pela publicação de diversos livros. Também organiza eventos multidisciplinares, como os Diálogos no CEM, que reúnem recorrentemente pesquisadores, intelectuais, ativistas e outros interessados nas diferentes temáticas ligadas às migrações.

O CEM da Missão Paz é um dos seis centros de estudos migratórios da Scalabrini International Migration Network (SIMN), os outros estão sediados em Buenos Aires (Argentina), Cidade do Cabo (África do Sul), Manila (Filipinas), Nova Iorque (EUA), Paris (França), e Roma (Itália).